Εκπαίδευση Image Analysis στην Πάτρα

Αυτή η εκπαιδευτική διαδραστική, ζωντανή εκπαίδευση στο Πάτρα (online ή onsite) απευθύνεται σε νέους μελετητές και επαγγελματικούς των εργαστηρίων, που θέλουν να επεξεργάζονται και να αναλύουν εικόνες σχετικά με ιστολογικές τκίσεις, αίματος κυττάρων, φυκών και άλλων βιολογικών δειγμάτων.

Στο τέλος αυτής της εκπαίδευσης, οι συμμετέχοντες θα μπορούν να:

• Πλοηγούνται στο διεπαφή του Fiji και να χρησιμοποιούν τις βασικές λειτουργίες του ImageJ.
• Προεξεργάζονται και να επιβελτιώνουν επιστημονικές εικόνες για καλύτερη ανάλυση.
• Να αναλύουν εικόνες με τρόπο ποσοτικό, συμπεριλαμβανομένων των κυττάρων και μέτρησης περιοχών.
• Να αυτοματοποιούν επαναλαμβανόμενες εργασίες χρησιμοποιώντας μακροκωδικές οδηγίες και πρόσθετα.
• Να προσαρμόζουν τα ρούτιν για συγκεκριμένες ανάγκες ανάλυσης εικόνων στη βιολογική έρευνα.

Το Fiji είναι ένα πακέτο ανοιχτού κώδικα για την επεξεργασία εικόνων, το οποίο συμπεριλαμβάνει το ImageJ (ένα πρόγραμμα για την επεξεργασία εικόνων για επιστημονικές πολυδιάστατες εικόνες) και μια σειρά plugin για την επιστημονική ανάλυση εικόνων.

Σε αυτή τη διδασκαλία με καθοδήγηση εκπαιδευτή, οι συμμετέχοντες θα μάθουν πώς να χρησιμοποιήσουν την κατανομή Fiji και το αντίγραφό του ImageJ για να δημιουργήσουν μια εφαρμογή ανάλυσης εικόνων.

Στο τέλος αυτής της κατάρτισης, οι συμμετέχοντες θα είναι σε θέση να:

• Να χρησιμοποιούν τις προηγμένες λειτουργίες προγραμματισμού και τα πρόγραμμα-κέιται του Fiji για να επεκτείνουν το ImageJ
• Να συνδυάζουν μεγάλες 3D εικόνες από κεφάλαια tiles
• Να αναβαθμίζουν αυτόματα μια εγκατάσταση Fiji κατά την έναρξη χρησιμοποιώντας το σύστημα αναβάθμισης που ολοκληρώνεται
• Να επιλέγουν από μια γενναιόδωρη επιλογή γλωσσών scripting για να κατασκευάζουν περιβάλλοντα προσαρμοσμένης ανάλυσης εικόνων
• Να χρησιμοποιούν τις δυνατές βιβλιοθήκες του Fiji, όπως την ImgLib σε μεγάλα bioimage datasets
• Να εφαρμόζουν την εφαρμογή τους και να συνεργάζονται με άλλους επιστήμονες σε παρόμοια έργα

Μορφή του Μαθήματος

• Διαδραστικός ρήτρα και συζήτηση.
• Πολλά ασκήματα και πράξεις.
• Εφαρμογή χειρόνικη σε ένα εργαστήριο live-lab environment.

Επιλογές Προσαρμογής Μαθήματος

• Για να ζητήσετε μια προσαρμοσμένη εκπαίδευση για αυτό το μάθημα, παρακαλώ επικοινωνήστε μαζί μας για να οργανώσετε.

Pattern Matching είναι μια τεχνική που χρησιμοποιείται για τον εντοπισμό καθορισμένων μοτίβων μέσα σε μια εικόνα. Μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τον προσδιορισμό της ύπαρξης καθορισμένων χαρακτηριστικών σε μια καταγεγραμμένη εικόνα, για παράδειγμα την αναμενόμενη ετικέτα σε ένα ελαττωματικό προϊόν σε μια εργοστασιακή γραμμή ή τις καθορισμένες διαστάσεις ενός εξαρτήματος. Διαφέρει από το "Pattern Recognition" (το οποίο αναγνωρίζει γενικά μοτίβα που βασίζονται σε μεγαλύτερες συλλογές σχετικών δειγμάτων) στο ότι υπαγορεύει συγκεκριμένα αυτό που ψάχνουμε και, στη συνέχεια, μας λέει εάν το αναμενόμενο μοτίβο υπάρχει ή όχι.

Μορφή του μαθήματος

• Αυτό το μάθημα εισάγει τις προσεγγίσεις, τις τεχνολογίες και τους αλγόριθμους που χρησιμοποιούνται στον τομέα της αντιστοίχισης προτύπων όπως ισχύει για το Machine Vision.