Course Outline
I. Εισαγωγή και προκαταρκτικά
1. Επισκόπηση
- Κάνοντας το R πιο φιλικό, R και διαθέσιμα GUI Rstudio Σχετικό λογισμικό και τεκμηρίωση R και στατιστικά Διαδραστική χρήση του R Μια εισαγωγική συνεδρία Λήψη βοήθειας με λειτουργίες και δυνατότητες Εντολές R, ευαισθησία πεζών-κεφαλαίων κ.λπ. Ανάκληση και διόρθωση προηγούμενων εντολών Εκτέλεση εντολών από ή εκτροπή εξόδου σε ένα αρχείο Μονιμότητα δεδομένων και αφαίρεση αντικειμένων Goαπό πρακτική προγραμματισμού: Αυτοδύναμα σενάρια, καλή αναγνωσιμότητα, π.χ. CRAN και Bioconductor
2. Ανάγνωση δεδομένων
- Αρχεία Txt (read.delim) Αρχεία CSV
3. Απλοί χειρισμοί. αριθμοί και διανύσματα + πίνακες
- Διανύσματα και ανάθεση Αριθμητική διανυσμάτων Δημιουργία κανονικών ακολουθιών Λογικά διανύσματα Λείπουν τιμές Διανύσματα χαρακτήρων Διανύσματα ευρετηρίου; επιλογή και τροποποίηση υποσυνόλων Πίνακες συνόλων δεδομένων
Λίστες Κατασκευή και τροποποίηση λιστών Συνένωση λιστών
- Πλαίσια δεδομένων Κατασκευή πλαισίων δεδομένων
6. Περισσότερα για την Ανάγνωση δεδομένων
- XLS, XLSX αρχεία ανάγνωσης και πακέτα readxl SPSS, SAS, Stata,… και άλλες μορφές δεδομένων Εξαγωγή δεδομένων σε txt, csv και άλλες μορφές
6. Ομαδοποίηση, βρόχοι και εκτέλεση υπό όρους
- Ομαδοποιημένες εκφράσεις Δηλώσεις ελέγχου Εκτέλεση υπό όρους: εάν εντολές Επαναληπτική εκτέλεση: για βρόχους, επανάληψη και κατά την εισαγωγή στην εφαρμογή, εφαρμογή, εφαρμογή, εφαρμογή
7. Λειτουργίες
- Δημιουργία συναρτήσεων Προαιρετικά ορίσματα και προεπιλεγμένες τιμές Μεταβλητός αριθμός ορισμάτων Πεδίο εφαρμογής και οι συνέπειές του
8. Απλά γραφικά στο R
- Δημιουργία γραφήματος Πυκνότητα Οικόπεδα Σημεία με κουκκίδες Γραμμές Γραμμές Διαγράμματα πίτας Γραφήματα πλαισίων Πλάκες διασποράς Οικόπεδα Συνδυασμός γραφημάτων
II. Στατιστική ανάλυση στο R
- 1. Κατανομές πιθανοτήτων
Το R ως σύνολο στατιστικών πινάκων Εξέταση της κατανομής ενός συνόλου δεδομένων
2. Έλεγχος Υποθέσεων
- Δοκιμές σχετικά με μια Δοκιμή αναλογίας μέσης πιθανότητας πληθυσμού Δοκιμές ενός και δύο δειγμάτων Δοκιμή Chi-Square GoΔοκιμασία odness-of-Fit Kolmogorov-Smirnov Statistic One-Sample Wilcoxon Signed-Rank Test Two-Sample Test Wilcoxon Rank Sum Test Mann-Whitney Δοκιμή Kolmogorov-Smirnov Test
3. Πολλαπλός Έλεγχος Υποθέσεων
- Σφάλμα τύπου Ι και καμπύλες ROC FDR και Πολλαπλές Διαδικασίες δοκιμών AUC (BH, Bonferroni κ.λπ.)
4. Μοντέλα γραμμικής παλινδρόμησης
- Γενικές συναρτήσεις για την εξαγωγή πληροφοριών μοντέλου Ενημέρωση προσαρμοσμένων μοντέλων Γενικευμένα γραμμικά μοντέλα Οικογένειες Η συνάρτηση glm()
Ταξινόμηση Logistic Regression
- Γραμμική Διακριτική Ανάλυση
III. Εργασμένα προβλήματα στη βιοπληροφορική
- Σύντομη εισαγωγή στο πακέτο limma Ροή εργασιών ανάλυσης δεδομένων Microarray Λήψη δεδομένων από το GEO: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE1397 Επεξεργασία δεδομένων (QC, κανονικοποίηση, διαφορική έκφραση) Παραδείγματα Custering ηφαιστείων + χάρτες θερμότητας
Testimonials (8)
The pace was just right and the relaxed atmosphere made candidates feel at ease to ask questions.
Rhian Hughes - Public Health Wales NHS Trust
Course - Introduction to Data Visualization with Tidyverse and R
Το περιεχόμενο, καθώς το βρήκα πολύ ενδιαφέρον και πιστεύω ότι θα με βοηθούσε στην τελευταία μου χρονιά στο Πανεπιστήμιο.
Krishan - NBrown Group
Course - From Data to Decision with Big Data and Predictive Analytics
Machine Translated
very tailored to needs
Yashan Wang
Course - Data Mining with R
how the trainor shows his knowledge in the subject he's teachign
john ernesto ii fernandez - Philippine AXA Life Insurance Corporation
Course - Data Vault: Building a Scalable Data Warehouse
Good real world examples, reviews of existing reports
Ronald Parrish
Course - Data Visualization
The trainer was so knowledgeable and included areas I was interested in
Mohamed Salama
Course - Data Mining & Machine Learning with R
Intensity, Training materials and expertise, Clarity, Excellent communication with Alessandra
Marija Hornis Dmitrovic - Marija Hornis
Course - Data Science for Big Data Analytics
Αισθάνομαι πιο σίγουρος με την κωδικοποίηση τώρα. Δεν το έχω ξανακάνει, αλλά τώρα καταλαβαίνω ότι δεν είναι επιστήμη πυραύλων και μπορώ να το κάνω όταν χρειαστεί.
Anna - Birmingham City University
Course - Foundation R
Machine Translated